2001 errichtete Orgelbaumeister Christoph Allgäuer eine neue zweimanualige Orgel im historischen Gehäuse. Dabei konnte das Brüstungspositiv mit vier Registern aktiviert werden. Im Hauptwerk stehen acht Register, im Pedalwerk vier Register - davon ein Zungenregister - zur Verfügung.
Heute hat sich das Instrument bei den Gottesdiensten gemeinsam mit Chor, Kantorinnen und Gemeindegesang bewährt. Immer wieder erklingen Orgelkonzerte im wunderbaren Klangraum der Kartausenkirche.