1135 wurde Grünbach erstmals urkundlich gennant. Zu dieser Zeit war ein Dienstadeliger des Markgrafen Leopold des Heiligen, ein Rüdiger von Grünbach, ansässig.
Die im Jahre 1111 gegründete Pfarre Meisling gilt als die Mutterpfarre von Niedergrünbach. Unter den vom Passauer Bischof lehenbaren Orten werden im Jahre 1302 Niedern – Gruenbach (Niedergrünbach), Obern – Gruenbach (Obergrünbach), Ortveins (Erdweis), Weizzen (Wietzen) und Grintdorf (Gründorf) genannt.
Das Pfarrverzeichnis der Passauer Diözese aus 1332 führt den Pfarrer von Meisling als Patron der Pfarre Grünbach an.
Wann die erste Kirche und der Pfarrhof erbaut wurden, ist unbekannt. Es gibt eine alte Darstellung der ursprünglichen Kirche, die ein kleiner gotischer Bau war. 1544 befand sich dieser schon, laut einem Visitationbericht, im baufälligen Zustand.
Im Dreißjärigen Krieg wurde die ganze Gegend von Rastenfeld ausgeplündert. 1657 ging der Besitz von Niedergrünbach an Johann Franz von Lamberg nach Ottenstein, der die Seelsorge in Niedergrünbach dem Pfarrer Straulin in Rastenfeld übertrug.
Karl Josef Graf von Lamberg hat die Pfarre Niedergrünbach mit seiner Stiftung vom 9. Dezember 1716 neu gegründet. Vorerst baute er den heutigen Pfarrhof mit Wappenschild (1717).
Pfarrer Mathias Drengeisen wurde erster Pfarrer in Niedergrünbach. Die Zeit von 1724 bis 1772, unter Pfarrer Christoph Kambl, war für die Pfarre Niedergrünbach eine Zeit des religiösen Auflebens
